Identifican dos genes que actúan como biomarcadores de un cáncer colorrectal

Un estudio del Centro de Investigación Príncipe Felipe (CIPF) ha identificado dos genes que actúan como biomarcadores específicos de un tipo de cáncer colorrectal poco conocido y que permitirá ofrecer tratamientos personalizados a los pacientes afectados. La investigadora Ana Conesa, del Laboratorio de Genómica de la Expresión Génica del CIPF, centra su estudio en un subtipo de cáncer colorrectal recientemente conocido, el adenocarcinoma serrado (SAC), que representa entre el 7'2 y 9,2% de los casos de este tipo de cáncer, ha informado la Generalitat en un comunicado.

Gracias a este estudio, recién publicado en la revista Clinical Epigenetics, se han identificado al menos dos genes (DIO3 y FOXD2) que podrían actuar como biomarcadores específicos para este tipo de cáncer y, con ello, permitirían estratificar a los pacientes y ofrecer tratamientos personalizados según el tipo de tumor. El adenocarcinoma serrado tiene peor pronóstico que el carcinoma convencional (CC) y presenta diferentes características histológicas y moleculares y, aunque su proporción dentro del cáncer colorrectal es baja, dado la alta incidencia de éste, hace que su importancia sea similar a la de, por ejemplo, el mieloma múltiple.

El peor pronóstico y escaso conocimiento del SAC hace más necesaria la identificación de biomarcadores específicos para este tipo de cáncer. El estudio abordó la caracterización de más de 450.000 marcas epigenómicas de metilación de ADN en una cohorte de 103 pacientes españoles y finlandeses. Las marcas epigenómicas son modificaciones no mutagénicas de los genes, que se pueden adquirir durante el crecimiento y que suelen tener un impacto importante sobre la actividad génica y frecuentemente la metilación se asocia a la pérdida de función del gen afectado.

Los biomarcadores epigenómicos son importantes porque pueden ser elementos de diagnóstico que no se encuentra en los "screens"genéticos convencionales y a la vez son más robustos que otras técnicas basadas en ARN. Este estudio del metiloma en pacientes afectados evidencia modelos de regulación epigenética en SAC que afectan a funciones que son claves para la morfología de este tipo de cáncer y que son similares en la población finlandesa y en la española.

Se identificaron hasta quince genes con un patrón de metilación aberrante entre el cáncer de colon serrado y el convencional y de ellos, los DIO3 y FOXD2 han sido validados con metodologías alternativas y, por lo tanto, pueden convertirse en biomarcadores específicos para este tipo de cáncer. Estos resultados corroboran estudios previos del equipo de investigación el cual identificó que el mismo tipo de características morfológicas estaban desreguladas en SAC, lo cual refuerza la solidez de estos biomarcadores.

Dadas las diferencias entre el SAC y el CC, el estudio propone a DIO3 y FOXD2 como dianas moleculares para el tratamiento del CRC a partir de una identificación histológica del subtipo de cáncer. El laboratorio de Conesa es especialista en el desarrollo de métodos estadísticos y software para el análisis de datos biomédicos masivos, empleados en la nueva medicina genómica.

Este trabajo representa un paso más para poder estratificar a los pacientes y ofrecer tratamientos personalizados eligiendo la terapia más adecuada para su tipo específico de tumor. Para desarrollar este trabajo, conesa ha colaborado con investigadores del Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Sanidad, la división del Centro Nacional de Genotipado (CEGEN), el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), la Fundación para la Formación e Investigación Sanitaria del Instituto de Salud Pública de la Región de Murcia y el Centro Regional de Hemodonación de Murcia.